综合管理部（行政、人事、财务）：以综合、协调、服务、联络、管理、日常接待为基本职能，起草制定年度工作计划安排；组织制订、修订有关规章制度；服务、协调重要活动、项目和业务工作开展；为会领导提供办公服务；负责文电、机要、印鉴、年检、会务、档案、安全保卫等机关日常运行与管理工作；负责信息管理与网络技术服务工作；组织企业家活动日和优秀企业家评选表彰活动，开展和参与相关问题调研工作。

雇主工作部（突出维权）：本会专事雇主工作的职能部门，代表本会参加国家协调劳工关系三方会议，参加有关劳动关系重大问题协调；参与有关涉及劳动关系方面的法律法规和政策的制定，维护企业和企业家合法权益；指导与协调各地、各行业企联/企业家协会开展三方机制建设和劳动关系协调工作；开展劳动关系调查和研究工作，组织开展三方机制和劳动关系方面的培训和工作交流；组织开展诚信企业评价活动，推动企业诚信建设；动员中国企业参加联合国全球契约及其国际、国内活动，积极引导企业履行社会责任，提供社会责任咨询、培训服务；参与国际劳工组织有关活动，开展与其他有关国家雇主组织的交流与合作。

企业维权部：   

项目开发部（商事，各项目组）：承担综合性研究和智力服务任务的业务部门，研发服务类产品，围绕协会职能，运用市场营销手段，负责协会重大项目的策划、跟踪、落实。

会员工作部（培训、宣传、政策）：本会负责会员发展、会员管理和会员服务的综合服务部门。主要职能是：发展会员、建立同会员单位及理事会成员的密切联系，管理会员数据库；制定理事会及会员管理制度；组织会员单位参与本会活动；归口为会员单位提供信息资料服务；反映企业和企业家诉求；收缴会费。同时，配合本会有关部门按期办理年检；为企业家开展健康促进工作提供科普宣教、健康管理、医疗协助、人才培养等多方面支持和服务。

县区分支机构：县区办事处，以设立人民调解中心、表彰先进、劳务派遣为结合点，在各县区选择威望企业作为机构负责人，接受协会统一管理。